树形不同
日本早樱的树高能达到17米，树皮呈灰色、横纹状。日本晚樱树皮呈银灰色，有唇形皮孔，高可达8米。
枝杆不同
早樱未长叶之时，树皮横纹状，老树皮纵裂。小枝颜色为褐色，树杆上的皮孔相对较稀少。而晚樱的树皮带银灰色，新芽较大，呈现深褐色，且皮孔小而多。
叶片不同
从叶子大小看，早樱的叶子比晚樱的叶子小。在形状方面，日本早樱的叶片形状是倒卵形至卵状披针形，而晚樱的叶片形状主要是椭圆状卵形，长椭圆形至倒卵形。
花形不同
早樱的花瓣有5枚，单瓣，花瓣形状为卵圆形，以白色为主，看起来花较稀少，而晚樱的花是重瓣，花量大。在未开时呈浅粉色，开花时的花色偏红，更为明艳。